我们的提议寻求创建和应用新的自上而下的糖-蛋白质组学程序,允许无偏见地发现蛋白质糖基化的改变。雷竞技app能赌吗这包括创建算法组装glycoproteoform网络从多维质谱(MS)的数据集,应用互相关分析链接glycoproteoform网络与光谱信息和证据的创建女士反馈策略允许统计得分具有独特glycoproteoform信息学工具。这项技术的创新之处在于,它可以用于评估在多个氨基酸残基处存在糖基化的糖蛋白,这是目前自上而下研究领域公认的瓶颈。
我们的目标还包括应用自顶向下的算法,使无监督发现糖蛋白生物标记物的生物液。雷竞技app能赌吗我们将使用这些新工具来监测脑胰岛素抵抗(BIR)啮齿动物模型的脑脊液(CSF),目的是发现与阿尔茨海默病(AD)谱系障碍相关的病理发展或临床症状相关的生物标记物。雷竞技app能赌吗特别是,我们试图建立啮齿类动物模型,以确定早期脑代谢功能障碍是否有助于淀粉样蛋白(A?)肽在脑血管和脑膜(MG)中的沉积,这是痴呆患者中常见的现象。一个吗?沉积物在老年人中偶尔发生,但在AD和唐氏综合征患者中发病率较高。如果不对大脑进行取样,这种沉积物很难诊断,而且往往要等到多发性脑出血和出现认知障碍后才能发现。这里,我们将确定BIR是否引入A?沉积在鼠类模型的脑血管和脑膜中,并与脑脊液中新蛋白的变化相关。这些实验有望为脑脊液受试者的评估提供候选标记。如果我们的项目目标成功,我们将不仅为糖科学家开发新的基础科学工具,而且为发现和开发基于糖蛋白的生物标志物建立了创新的临床蛋白组学程序。雷竞技app能赌吗

公共卫生的相关性

自上而下的质谱是对生物化学的敬意。真核生物的化学反应是在时间和空间中进行的;然而,外部刺激(环境和疾病)不断地劫持这些过程。这项研究的目标是开发下一代蛋白质组学工具,在正常的真核生物生理学以及与阿尔茨海默病谱系障碍相关的病理生物学背景下,快速量化难以预测的化学反应途径中翻译基因的化学反应。

机构
国家卫生研究所(NIH)
研究所
国家普通医学科学研究所
类型
研究项目(R01)
项目#
1 r01gm115739-01a1
应用#
9106486
研究部门
促进生物分析及影像技术研究组(EBIT)
项目官员
Sheeley,道格拉斯
项目开始
2016-04-01
项目结束
2021-03-31
预算开始
2016-04-01
预算结束
2017-03-31
支持一年
1
财政年度
2016
总成本
间接成本
的名字
达拉斯德克萨斯大学西南医学中心
部门
病理
类型
学校医学
兔褐#
800771545
城市
达拉斯
状态
TX
国家
美国
邮政编码
75390
柯克帕特里克,克里斯汀·L;欧芹,妮可C;Tessa E等人。(2018)利用pepsavie - ms从细菌分泌液中探索生物活性肽:粪肠球菌pPD1中Bac-21的鉴定和鉴定生物科技活》11:943 - 951
Plymire,丹尼尔;翼,凯西E;达纳·罗宾逊等人。(2017)用浅孔反相液相色谱-傅里叶变换质谱连续洗脱鉴定髓鞘碱性蛋白的蛋白形态。肛门化学89:12030 - 12038
法,Steven M(2016)自上而下质谱分析:从蛋白质组学到蛋白质形态。Adv Exp Med Biol 919:171-200